Банки нанимают специалистов со знанием 1С Битрикс и пишут модули для приема платежей на сайтах. Бывают бесплатные модули на маркетплэйс.
Мне приходилось писать платежные системы для банков, также много раз внедрял сторонние модули, дорабатывал их, взаимодействуя с техподержкой банков. Поэтому, если у вас возникла необходимость подключить платежную систему, напишите и сертифицированный программист 1с битрикс настроит интернет-эквайринг на вашем сайте.